Фундаментальная библиотекаУниверситета основана в 1897 году одновременно с созданием Женского медицинского института благодаря книжным дарам известных ученых-медиков.
Самoe крупнoe собрание книг профессора Военно-Медицинской академии Ю.Т.Чудновского (1843-1896гг) послужило началом создания библиотеки.
Коллекция профессора Санкт-Петербургского университета физиолога Н.И.Бакста (1843-1904гг.), завещанная библиотеке, включает издания по физиологии, биохимии и смежным наукам. Наиболее значительным был дар врача-библиографа, историка русской медицины Л.Ф. Змеева (1832-1901гг), автора знаменитого библиографического указателя «Русские врачи-писатели» (1886-1899).
Всего фонд редких книг насчитывает около 1000 экз на русском и иностранных языках. В библиотеке есть издания, принадлежавшие И.М.Сеченову, книги с автографами И.П.Павлова, С.П.Боткина, К.А.Тимирязева и др.
В настоящее время фонд библиотеки насчитывает около 750 тысяч единиц хранения. В репертуаре представлена научно-медицинская, учебная, художественная, отраслевая литература. Десятки учебников изданы ведущими учеными Университета и переведены на испанский, английский, французский, китайский и другие языки мира. Самый популярный учебник - «Анатомия человека» - написан в 1958 году заслуженным деятелем науки профессором М.Г. Привесом и многократно переиздан.
Библиотекой пользуются 9000 читателей.
Информация об имеющихся в библиотеке изданиях отражена в Электронном каталоге, который включает базы данных книг, периодических изданий, авторефератов и диссертаций. Аннотированная информация о новых поступлениях в библиотеку и тестовых доступах к полнотекстовым медицинским ресурсам рассылается по кафедрам и размещается на сайте Университета.
В библиотеке используется автоматизированная библиотечно-информационная система ИРБИС-64, дающая возможность пользователям Интернет осуществлять поиск по Электронному каталогу в режиме удаленного доступа. Система полностью отвечает международным требованиям, обладает высокой скоростью выполнения поисковых запросов различной сложности, позволяет работать с ней одновременно большому количеству пользователей, дает возможность создания полнотекстовых баз данных, позволяет автоматизировать библиотечные процессы от поступления литературы в библиотеку до выдачи ее пользователю.
Создана электронная коллекция «Редкая книга», репозиторий учебных материалов.
Правила пользования библиотекой ФГБОУ ВО ПСПбГМУ им. акад. И.П. Павлова